个体工商户开票100万时，常见错误操作有：
1. 忽视成本扣除：未保留发票或凭证，无法合法扣除成本，增加应纳税所得额。正确做法是妥善保存经营相关票据。
2. 未依规申报：误以为开票未到账就无需申报，实则只要有经营收入，就需依法申报，否则可能罚款。
3. 收入性质混淆：将经营所得与其他收入混淆，可能适用错误税率，增加税负或引发税务风险。
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个体工商户开票100万涉及的税款计算需结合具体情况：
主要涉及增值税和个人所得税（经营所得），具体金额取决于是否达到增值税起征点、成本费用是否可扣除、适用税率等因素：
1. 月销售额未超10万元（增值税起征点），免征增值税。
2. 已办一般纳税人资格，按适用税率（3%或6%等）全额缴纳增值税。
3. 有可扣除成本费用的，经营所得减少，适用税率降低。
4. 无成本费用扣除的，应纳税所得额为100万，按5%-35%超额累进税率计算个人所得税。
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个体工商户开票100万处理中，可能遇到以下特殊情况：
1. 税收优惠情形：若所在行业或地区有税收减免政策（如小微企业优惠、地方扶持政策），实际税负可能大幅降低，甚至免征或减征。例如部分地区对月销售额10万元以下个体户免征增值税和个人所得税。
2. 亏损或成本异常：若当年经营亏损或成本费用明显偏高，可能被税务机关怀疑真实性，影响应纳税所得额核定，甚至触发稽查。
3. 跨区域经营开票：多地区开展业务或跨区域开票，涉及不同税务管辖和政策差异，增加申报管理难度，可能导致重复征税或税务争议。
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个体工商户开票100万需注意以下法律风险点：
1. 税务稽查风险：长期大额开票但申报税额偏低，易引发税务机关稽查，最终可能面临补税、滞纳金或行政处罚。例如某个体户连续数月百万开票，申报收入远低于开票额，被认定为偷税。
2. 信用评级受损风险：税务违规会影响信用记录，进而影响后续贷款、政府采购、招投标等经营活动。例如某个体户未按时申报被列入“非正常户”，导致银行拒贷。

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